173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1742 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1742  Na/Pi-cotransporter family protein  100 
 
 
543 aa  1087    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1829  Na+/Pi-cotransporter  78.45 
 
 
543 aa  765    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2138  Na+/Pi-cotransporter  54.24 
 
 
561 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0273638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2155  Na+/Picotransporter  48.18 
 
 
557 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2061  Na+/Picotransporter  48.47 
 
 
557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.803525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1565  Na+/phosphate symporter  36.09 
 
 
562 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9722500000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2560  Na+/phosphate symporter  32.54 
 
 
557 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.46827e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  34.59 
 
 
536 aa  310  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0213  Na/Pi-cotransporter II-related protein  33.09 
 
 
556 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.550042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1581  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.76 
 
 
576 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21650  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30 
 
 
548 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  30.24 
 
 
537 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.74 
 
 
541 aa  272  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  29.87 
 
 
537 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.61 
 
 
541 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.61 
 
 
541 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.61 
 
 
541 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1044  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.53 
 
 
574 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.53118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0173  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.07 
 
 
559 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00842075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.06 
 
 
538 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.87 
 
 
554 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  29.47 
 
 
551 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  29.52 
 
 
551 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  29.52 
 
 
551 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.19 
 
 
539 aa  258  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  29.21 
 
 
551 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  29.39 
 
 
551 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  29.39 
 
 
544 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  29.02 
 
 
551 aa  256  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  28.84 
 
 
551 aa  256  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  28.84 
 
 
551 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1780  Na+/Pi-cotransporter  33.65 
 
 
544 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2810  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.31 
 
 
584 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.78 
 
 
551 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.73 
 
 
551 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000310197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  34.01 
 
 
559 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.67 
 
 
549 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0092  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.65 
 
 
555 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0096  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.65 
 
 
555 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2825  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.12 
 
 
590 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.28 
 
 
567 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.49 
 
 
643 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.17 
 
 
566 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0476  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.23 
 
 
586 aa  224  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1964  Na/Pi cotransporter family protein  28.55 
 
 
549 aa  223  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0384017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  29.07 
 
 
535 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.66 
 
 
556 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2438  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.45 
 
 
636 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.84 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.43 
 
 
564 aa  197  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1191  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.51 
 
 
570 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1230  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.79 
 
 
564 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0949  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.82 
 
 
587 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506684 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  24.91 
 
 
556 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000135688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.53 
 
 
565 aa  190  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1146  Na/Pi cotransporter II-related  30.45 
 
 
555 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.35 
 
 
558 aa  170  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0064  Na+/Pi-cotransporter  29.48 
 
 
586 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3663  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.38 
 
 
535 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1777  Na/Pi cotransporter II-related  29.43 
 
 
600 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790059  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0064  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.51 
 
 
318 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2859  Na+/H+ antiporter  30.39 
 
 
554 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.239008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1114  Na+/Pi-cotransporter  26.86 
 
 
566 aa  156  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  27.55 
 
 
563 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0079  Na+/Pi-cotransporter  25.76 
 
 
592 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0444  hypothetical protein  29.47 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.27 
 
 
576 aa  147  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.79 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  29.5 
 
 
563 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  27.4 
 
 
565 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.19 
 
 
552 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1876  Na+/Pi-cotransporter  32.33 
 
 
289 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00688097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.63 
 
 
577 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  27.11 
 
 
558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.6 
 
 
601 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1907  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.55 
 
 
556 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2510  Na+/H+ antiporter  26.59 
 
 
572 aa  134  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.437646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.71 
 
 
556 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.27 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  24 
 
 
561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.11 
 
 
548 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2431  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.15 
 
 
310 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816248  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  24.9 
 
 
548 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.1 
 
 
311 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.138748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0962  Na+/Pi-cotransporter  27.46 
 
 
578 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.126514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4094  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.26 
 
 
304 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.890798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  22.08 
 
 
560 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.9 
 
 
562 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2947  Na+/Picotransporter  26.62 
 
 
548 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  24.44 
 
 
556 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  22.74 
 
 
582 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  22.56 
 
 
582 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1012  Na+/Pi-cotransporter  30.26 
 
 
308 aa  120  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0461  Na+/Pi-cotransporter  32.77 
 
 
554 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.790471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  23.65 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  25.54 
 
 
562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2701  Na+/Pi-cotransporter  26.97 
 
 
611 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  21.64 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  25.92 
 
 
548 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  25.58 
 
 
553 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>