73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1736 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  285  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  87.41 
 
 
143 aa  258  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  87.41 
 
 
143 aa  254  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  83.22 
 
 
143 aa  244  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  83.92 
 
 
143 aa  242  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14069e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  82.52 
 
 
143 aa  236  6e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  79.72 
 
 
143 aa  233  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  70.42 
 
 
170 aa  210  5e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  71.33 
 
 
143 aa  210  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  68.09 
 
 
143 aa  205  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  68.09 
 
 
143 aa  200  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  66.43 
 
 
143 aa  197  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  67.38 
 
 
143 aa  191  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.84 
 
 
143 aa  188  3e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  63.64 
 
 
143 aa  187  3e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  62.68 
 
 
143 aa  186  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.04 
 
 
143 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  59.44 
 
 
143 aa  174  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  61.94 
 
 
143 aa  174  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  56.64 
 
 
143 aa  169  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  55.94 
 
 
143 aa  167  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  52.86 
 
 
142 aa  164  3e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  53.85 
 
 
143 aa  164  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 
143 aa  160  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 
143 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.59 
 
 
147 aa  147  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.19299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
147 aa  136  8e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 
147 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 
147 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  44.76 
 
 
147 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.88 
 
 
144 aa  135  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.76 
 
 
141 aa  132  2e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.76 
 
 
141 aa  132  2e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
141 aa  130  7e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
141 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
143 aa  127  5e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  43.45 
 
 
149 aa  127  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.25 
 
 
142 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  42.75 
 
 
145 aa  120  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.27 
 
 
144 aa  119  1e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  42.96 
 
 
142 aa  119  1e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.59 
 
 
145 aa  117  4e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.04 
 
 
135 aa  117  4e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  40.97 
 
 
142 aa  117  5e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  40.56 
 
 
142 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  38.3 
 
 
151 aa  116  1e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  40.44 
 
 
142 aa  115  2e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  38.13 
 
 
142 aa  113  9e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  46.4 
 
 
145 aa  112  2e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  42.45 
 
 
144 aa  109  2e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.54 
 
 
143 aa  107  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.3 
 
 
142 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  37.5 
 
 
129 aa  104  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 
129 aa  103  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  45.24 
 
 
144 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  37.1 
 
 
129 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  33.58 
 
 
151 aa  87  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  37.5 
 
 
144 aa  82.4  2e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.58 
 
 
153 aa  80.1  1e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  37 
 
 
129 aa  79.7  1e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  37 
 
 
129 aa  79  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  36 
 
 
129 aa  78.2  4e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39 
 
 
129 aa  72  2e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 
137 aa  66.2  1e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  51.6  4e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27 
 
 
128 aa  51.2  5e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  23.31 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  26.55 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.45 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>