More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1708 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  100 
 
 
420 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  81.16 
 
 
421 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  59.37 
 
 
415 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  55.34 
 
 
414 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  55.58 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  51.07 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  52.34 
 
 
413 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  39.16 
 
 
428 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  32.84 
 
 
449 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  30.07 
 
 
428 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  33.1 
 
 
424 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  33.33 
 
 
399 aa  156  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  31.72 
 
 
468 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  30.93 
 
 
392 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  31.18 
 
 
368 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  28.54 
 
 
451 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.06 
 
 
439 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  31.63 
 
 
416 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  31.59 
 
 
428 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.67 
 
 
451 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.67 
 
 
484 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  28.47 
 
 
457 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.43 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.32 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  32.33 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  29.66 
 
 
430 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.75 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.88 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.03 
 
 
663 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  30.53 
 
 
432 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.95 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  31.45 
 
 
388 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  30.08 
 
 
442 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  26.04 
 
 
462 aa  126  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  32.45 
 
 
399 aa  126  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.02 
 
 
431 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  30.46 
 
 
299 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.67 
 
 
434 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  30.96 
 
 
478 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.84 
 
 
660 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  30.89 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.94 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  29.79 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.7 
 
 
447 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  29.66 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  29.06 
 
 
433 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.43 
 
 
441 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.89 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.17 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  29.38 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.88 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  27.2 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.39 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.07 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.2 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.71 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.91 
 
 
422 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  29.02 
 
 
431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  26.67 
 
 
663 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  32.22 
 
 
444 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.84 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  31.07 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.59 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  31.07 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  32.38 
 
 
445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  26.91 
 
 
428 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  26.23 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.27 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  31.79 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.12 
 
 
442 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.63 
 
 
656 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.44 
 
 
455 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.75 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  26.67 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.7 
 
 
422 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.57 
 
 
444 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.67 
 
 
440 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  30.75 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  25.07 
 
 
422 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.3 
 
 
438 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  26.96 
 
 
422 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.46 
 
 
432 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 
458 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  24.69 
 
 
420 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  29.81 
 
 
373 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  28.78 
 
 
426 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.11 
 
 
444 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.21 
 
 
447 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  32.49 
 
 
412 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  26.18 
 
 
444 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  27.09 
 
 
442 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.96 
 
 
431 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  28.16 
 
 
443 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.07 
 
 
445 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  32.49 
 
 
412 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  28.74 
 
 
434 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  25.06 
 
 
406 aa  103  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  28.46 
 
 
421 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.29 
 
 
431 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.06 
 
 
443 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>