50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1680 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  54.55 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  63.64 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  57.34 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  52.45 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  45.45 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  44.76 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  36.57 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  31.91 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  37.41 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  30.5 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  35.42 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  31.21 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  33.08 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  31.34 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  30.83 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  34.59 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  34.51 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  30.37 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  32.87 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  34.51 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  36.11 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  27.82 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  33.58 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  31.47 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  27.97 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  29.82 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  31.06 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  29.85 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  26.87 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  32.54 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  28.89 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  28.28 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  38.03 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  27.01 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  29.32 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  25.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  31.06 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  26.47 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>