More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1659 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 413 aa  853    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  78.97 
 
 		 416 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  81.75 
 
 		 415 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  88.83 
 
 		 413 aa  765    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  78.87 
 
 		 416 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  73.22 
 
 		 414 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  68.66 
 
 		 419 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  65.76 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 426 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  48.38 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 421 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 425 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 420 aa  362  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 423 aa  360  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 446 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 424 aa  358  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 446 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>