More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1630 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  100 
 
 		 710 aa  1433    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.06 
 
 		 694 aa  798    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.2 
 
 		 694 aa  813    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  79.86 
 
 		 690 aa  1104    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.74 
 
 		 697 aa  973    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 695 aa  200  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  35.5 
 
 		 709 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 710 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  35.15 
 
 		 727 aa  171  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.46 
 
 		 785 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.58 
 
 		 881 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 665 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3734  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 665 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 686 aa  157  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 456 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 561 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 489 aa  153  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 754 aa  154  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 905 aa  151  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 755 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 955 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 885 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 715 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 612 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1391 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 645 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 762 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 695 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1064 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 906 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  24.28 
 
 		 688 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  25.42 
 
 		 581 aa  147  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  24.28 
 
 		 688 aa  147  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  26.89 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 1319 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 899 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 763 aa  145  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 884 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 1039 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2123  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 688 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.267371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 1260 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 		 1237 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 625 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1085 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1439  two-component sensor histidine kinase  24.13 
 
 		 689 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 715 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.05 
 
 		 767 aa  144  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1042 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 421 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 1003 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  24.03 
 
 		 685 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.53 
 
 		 464 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  25.64 
 
 		 581 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 2783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 1010 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 772 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 771 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 718 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 771 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 621 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 771 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 771 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  26.27 
 
 		 1683 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 669 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  28.44 
 
 		 1399 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 368 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 682 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 		 771 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 637 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  29.21 
 
 		 1206 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 		 696 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  30.22 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 765 aa  140  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 726 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 792 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 377 aa  140  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.78 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 620 aa  139  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.78 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 581 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  27.44 
 
 		 587 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  27.1 
 
 		 587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 658 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.826724 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  27.1 
 
 		 587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 819 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  33.46 
 
 		 576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 		 1133 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 725 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1287 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 639 aa  138  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>