More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1585 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  77.99 
 
 
159 aa  254  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  67.3 
 
 
159 aa  225  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  66.25 
 
 
160 aa  215  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  64.38 
 
 
160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  64.78 
 
 
161 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  61.01 
 
 
159 aa  187  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  52.83 
 
 
154 aa  154  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  49.69 
 
 
171 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  51.85 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  51.33 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  47.74 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  47.1 
 
 
171 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  47.1 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  45.03 
 
 
154 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  47.68 
 
 
152 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  43.83 
 
 
185 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  49.33 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  41.61 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  45.16 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  46.98 
 
 
176 aa  124  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  43.75 
 
 
154 aa  120  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  44.22 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  39.62 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  43.92 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  41.67 
 
 
159 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  41.14 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  45.62 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  48.46 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  39.75 
 
 
157 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  37.89 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  41.56 
 
 
156 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  46.38 
 
 
153 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  45 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  40.91 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  37.01 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  42.86 
 
 
151 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  42.18 
 
 
151 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  42.58 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  40.4 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  39.46 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  44.3 
 
 
151 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  41.22 
 
 
154 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.42 
 
 
152 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  37.82 
 
 
151 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.42 
 
 
152 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  44.83 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.5 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.5 
 
 
152 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  40.82 
 
 
151 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  43.05 
 
 
151 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  39.33 
 
 
155 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  43.71 
 
 
144 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  44.2 
 
 
161 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  40.25 
 
 
157 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  37.82 
 
 
154 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  40.82 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  40.82 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  37.5 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  38.52 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  37.09 
 
 
155 aa  97.1  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  39.73 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  38.36 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  36.88 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  40.76 
 
 
286 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  40.14 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  42.65 
 
 
196 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  40.29 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  42.75 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  44.2 
 
 
191 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.85 
 
 
151 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  40.29 
 
 
153 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  42.75 
 
 
154 aa  94  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  37.78 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  39.57 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  32.9 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  38.16 
 
 
204 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  43.48 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  38.41 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  38.41 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  38.41 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  38.41 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  39.55 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  42.75 
 
 
150 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>