More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1583 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 240 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  74.89 
 
 		 241 aa  348  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  65.4 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  64.56 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  60.42 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  61.18 
 
 		 264 aa  287  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  59.32 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  47.23 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  44.92 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  46.86 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.67 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  42.49 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  43.48 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  43.27 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  43 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  41.86 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  42.23 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  42.31 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  41.06 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  37.8 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  43.11 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  39 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  34.55 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  43.32 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  36.1 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  41.11 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  38.74 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  40.99 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  39.77 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  42.51 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  38.83 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  44.57 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  44.57 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  36.49 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  39.49 
 
 		 186 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  38.6 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  39.81 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  39.48 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  39.25 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  38.36 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  35.44 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  31.78 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  35.24 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  43.15 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  37.44 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  37.13 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  36.7 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2678  dithiobiotin synthetase  33.47 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3426  dithiobiotin synthetase  33.47 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  37.9 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  35.55 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  36.89 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.14 
 
 		 646 aa  112  5e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  35.81 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  43.02 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  33.64 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  36.41 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  42.93 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  35.52 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  35.41 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  36.64 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  35.89 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  37.14 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  35.91 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  34.29 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  32.17 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  40.88 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  37.67 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  37.2 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  39.15 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  33.5 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  35.19 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  31.51 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>