More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1511 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
382 aa  779    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
756 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1177 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
1177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
543 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
579 aa  103  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
394 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
773 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
371 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
387 aa  96.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
439 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  29.83 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
478 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
384 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
376 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
744 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
412 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
370 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  29.12 
 
 
393 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
386 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
385 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.18 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.34 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
395 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.8 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  32.33 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  27.53 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  34.48 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  27.3 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  27.99 
 
 
350 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
739 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.75 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.2 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.81 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  27.65 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  33.55 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.17 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.78 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.39 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>