More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1486 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1486  MttB family protein  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1387  Sec-independent periplasmic protein translocase  87.18 
 
 
286 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.02646  normal  0.486674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  75.9 
 
 
278 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000498053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2600  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  71.07 
 
 
282 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.143785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1626  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  71.07 
 
 
282 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.48 
 
 
289 aa  401  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1242  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  66.67 
 
 
283 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00016128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.98 
 
 
257 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.69 
 
 
259 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
264 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.58 
 
 
324 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  36.5 
 
 
250 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.29 
 
 
468 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.69 
 
 
257 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.98 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  31.88 
 
 
271 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  31.2 
 
 
271 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  30.56 
 
 
266 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.51 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  31.91 
 
 
299 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.5 
 
 
268 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  27.5 
 
 
268 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.7 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.42 
 
 
289 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  30.42 
 
 
289 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.67 
 
 
287 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  29.85 
 
 
368 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.27 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  29.28 
 
 
296 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.15 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.68 
 
 
247 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  29.69 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.55 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.3 
 
 
268 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.41 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  27.44 
 
 
269 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.13 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.85 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.42 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  29.48 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.59 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.63 
 
 
275 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  28.52 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.73 
 
 
274 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  30.07 
 
 
262 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.31 
 
 
241 aa  125  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.21 
 
 
265 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.51 
 
 
272 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.62 
 
 
258 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  32.28 
 
 
256 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  30.5 
 
 
245 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.45 
 
 
262 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.95 
 
 
253 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  28.09 
 
 
251 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 
245 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  27.44 
 
 
346 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 
245 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  28.41 
 
 
262 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.41 
 
 
262 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  29.24 
 
 
278 aa  122  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
259 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
259 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
259 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
259 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
259 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.79 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  27.88 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.1 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  29.58 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  28.4 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  27.86 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.53 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  29.53 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  26.48 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.93 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  33.67 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.41 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  28.09 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.94 
 
 
250 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  29.19 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.16 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  30.18 
 
 
321 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  26.77 
 
 
250 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  26.6 
 
 
323 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  29.18 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.83 
 
 
347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  27.31 
 
 
249 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.9 
 
 
258 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.88 
 
 
259 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.7 
 
 
263 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.67 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>