More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1445 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 
593 aa  1210    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  50 
 
 
636 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  47.9 
 
 
652 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  39.3 
 
 
627 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  39.48 
 
 
650 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  40.59 
 
 
618 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2389  TonB-dependent receptor plug  38.87 
 
 
615 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000607441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2900  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 
609 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1830  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 
616 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  37.69 
 
 
621 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  37.06 
 
 
626 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1178  TonB-dependent receptor plug  34.86 
 
 
621 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3117  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 
619 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 
705 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.39 
 
 
639 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 
634 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.76 
 
 
633 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
648 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.69 
 
 
646 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 
657 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
653 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  27.45 
 
 
620 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 
634 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.38 
 
 
659 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.37 
 
 
663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
697 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.37 
 
 
663 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.19 
 
 
663 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 
663 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.19 
 
 
663 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.19 
 
 
663 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.42 
 
 
641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
621 aa  114  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  25.2 
 
 
744 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  26.34 
 
 
650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  26.52 
 
 
650 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.34 
 
 
650 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
647 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  26.34 
 
 
650 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.34 
 
 
650 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.8 
 
 
744 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  25.29 
 
 
746 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 
634 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
682 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.13 
 
 
638 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
653 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  25.04 
 
 
744 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
619 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
709 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.16 
 
 
695 aa  107  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 
668 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
625 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.23 
 
 
623 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.68 
 
 
656 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
649 aa  104  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 
671 aa  104  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
602 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 
597 aa  104  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
662 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 
702 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
661 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
662 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
638 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 
621 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.4 
 
 
663 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
662 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 
649 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
680 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.55 
 
 
728 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  24.16 
 
 
724 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.95 
 
 
671 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  24.63 
 
 
751 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
649 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 
679 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  23.99 
 
 
724 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  24.63 
 
 
751 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  24.63 
 
 
751 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  24.23 
 
 
742 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
698 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.96 
 
 
661 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
698 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  24.39 
 
 
703 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
623 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
698 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  24.58 
 
 
746 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  23.99 
 
 
724 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  23.99 
 
 
724 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.74 
 
 
630 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  24.83 
 
 
746 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.74 
 
 
630 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  24.58 
 
 
746 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  24.58 
 
 
746 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  24.83 
 
 
746 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
641 aa  98.2  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  24.83 
 
 
746 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  24.58 
 
 
746 aa  98.2  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 
746 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  24.42 
 
 
750 aa  97.8  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>