More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1398 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  100 
 
 
193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  65.75 
 
 
193 aa  249  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  43.59 
 
 
207 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  41.03 
 
 
235 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.91 
 
 
222 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 
425 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 
218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  31.89 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
217 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  31.35 
 
 
218 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  32.43 
 
 
218 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  33.7 
 
 
194 aa  104  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 
363 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 
327 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 
327 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  32.85 
 
 
356 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 
327 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 
340 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  30.19 
 
 
207 aa  84.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  35.59 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  35.59 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  35.59 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  35.59 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  26.39 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  34.75 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  34.75 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  34.75 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  34.75 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  29.33 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  30.37 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  38.39 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  27.89 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  27.57 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  34.23 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  35.35 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  33.87 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  32.23 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  31.09 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  27.62 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.75 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  30.18 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  28.23 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  29.29 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  25.76 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  26.21 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  29.29 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  30.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  29.29 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  29.29 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  29.92 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  26.32 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  26.09 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  27.86 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  26.04 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  25.77 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  25.77 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  29.55 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  26.87 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  26.98 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  30.61 
 
 
444 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  30.56 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  29.14 
 
 
291 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  26.32 
 
 
219 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.03 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  28.03 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  24.83 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  28.03 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  27.97 
 
 
209 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  28.75 
 
 
210 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  24.46 
 
 
201 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  30.1 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  30.19 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 
283 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  27.36 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 
248 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>