19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1376 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  55.19 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  53.85 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  52.03 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  45.96 
 
 		 250 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  52 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  38.52 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  37.73 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  37.14 
 
 		 238 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  36.4 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  37.77 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  34.53 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  29.24 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  28.63 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  26.95 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  27.86 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  26.26 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  27.31 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>