21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1368 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  48.08 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  47.55 
 
 		 284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0849  hypothetical protein  42.76 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0937749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0713  hypothetical protein  47.67 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.144173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3401  hypothetical protein  76.23 
 
 		 136 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  40.43 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  53.76 
 
 		 109 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  36.97 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1755  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0228  hypothetical protein  51.85 
 
 		 97 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.939073  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  30.32 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1760  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  23.23 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0026  hypothetical protein  23.71 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.867937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  23.04 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  34.95 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  25.91 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  30.11 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3355  hypothetical protein  24.88 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  29.29 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>