132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1327 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  57.48 
 
 		 319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  38.03 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  36.52 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  34.15 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  34.15 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  34.75 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  35.23 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  35.21 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  35.69 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  33.92 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  35.46 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  34.68 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  33.81 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  32.23 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  31.27 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  33 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  31.31 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  26.4 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  28.5 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  29.15 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  25.75 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  25.47 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  29.26 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  29.26 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  25.88 
 
 		 804 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  24.32 
 
 		 841 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.94 
 
 		 615 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.42 
 
 		 609 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  28.57 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  29.22 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.32 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  24.19 
 
 		 819 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  25.66 
 
 		 1180 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  30.96 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  24.59 
 
 		 781 aa  56.2  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  30.28 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.78 
 
 		 605 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.8 
 
 		 615 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.44 
 
 		 616 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.39 
 
 		 637 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  30.94 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  31.55 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1468  methionine synthase I  28.64 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799153  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  25.28 
 
 		 800 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  27.53 
 
 		 1191 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.39 
 
 		 610 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.29 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  29.41 
 
 		 1176 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  28.37 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  23.22 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  32 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  31.05 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  29.61 
 
 		 1208 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  25.13 
 
 		 1224 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.03 
 
 		 774 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.07 
 
 		 610 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2255  homocysteine S-methyltransferase  24.77 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  28.7 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.4 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1074  methionine synthase I  28.29 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.24236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  25.3 
 
 		 793 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  25.08 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  24.6 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.09 
 
 		 1208 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  30.16 
 
 		 1190 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  28.24 
 
 		 1197 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.42 
 
 		 605 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  34.03 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  24.29 
 
 		 780 aa  49.3  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  24.81 
 
 		 813 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  24.53 
 
 		 839 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  29.89 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  25.64 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  24.47 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  25.16 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  29.91 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  29.05 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1771  methionine synthase I  23.36 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.0676063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  28.06 
 
 		 1208 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  24.69 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  22.18 
 
 		 1132 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.26 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.21 
 
 		 806 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.29 
 
 		 613 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  22.29 
 
 		 613 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  21.82 
 
 		 1132 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  27.32 
 
 		 1191 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  27.32 
 
 		 1191 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  25.29 
 
 		 811 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  21.82 
 
 		 1132 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  22.46 
 
 		 1132 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  22.74 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  27.24 
 
 		 803 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  29.08 
 
 		 1178 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  27.57 
 
 		 1254 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  25.7 
 
 		 1214 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  21.82 
 
 		 1133 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  31.43 
 
 		 1226 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>