More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1281 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  503  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  83.87 
 
 		 252 aa  427  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  78.31 
 
 		 250 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  72.18 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  71.77 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  72.47 
 
 		 266 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 		 254 aa  340  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  64.11 
 
 		 254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  67.47 
 
 		 255 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  63.75 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  61.45 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.51 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  55.32 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.51 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.03 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 		 252 aa  242  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  51.93 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  47.6 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  45.8 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  47.48 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.12 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  47.2 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.54 
 
 		 281 aa  235  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.96 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 264 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.34 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.36 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  49.15 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.95 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  45.27 
 
 		 398 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  52.97 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  52.97 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  44.86 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 453 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  53.74 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.44 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 440 aa  214  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  39.59 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.5 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  41.84 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 		 541 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 395 aa  210  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.86 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.21 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  44.3 
 
 		 568 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 403 aa  208  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 402 aa  207  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  43.46 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 403 aa  204  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  40.08 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 411 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 456 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.56 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  42.62 
 
 		 380 aa  198  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  44.12 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.62 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.05 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 568 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  38.17 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  42.19 
 
 		 571 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  38.4 
 
 		 574 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.44 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  41.05 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  41.05 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.66 
 
 		 281 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  40.34 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  41.25 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  41.8 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  46.72 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 		 288 aa  185  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  41.63 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  42.32 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.78 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.25 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>