More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1205 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  100 
 
 
157 aa  320  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  86.54 
 
 
156 aa  282  1e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  74.19 
 
 
156 aa  254  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.31 
 
 
158 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.41 
 
 
160 aa  134  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  39.49 
 
 
159 aa  106  9e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  35.93 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.65 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.32 
 
 
203 aa  74.7  5e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.69 
 
 
220 aa  73.9  7e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
198 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  29.76 
 
 
190 aa  73.2  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  33.1 
 
 
197 aa  73.2  1e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  34.03 
 
 
197 aa  73.2  1e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  30.88 
 
 
189 aa  71.6  3e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  32.61 
 
 
201 aa  72  3e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  32.39 
 
 
197 aa  72  3e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  32.09 
 
 
186 aa  72  3e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 
199 aa  71.6  4e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  32.61 
 
 
201 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.88 
 
 
201 aa  71.2  4e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  32.61 
 
 
201 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68945e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  32.32 
 
 
201 aa  70.9  7e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.04 
 
 
202 aa  70.9  7e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  32.61 
 
 
201 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.61 
 
 
198 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.61 
 
 
201 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.48 
 
 
209 aa  69.7  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  30.5 
 
 
200 aa  70.1  1e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.94 
 
 
200 aa  70.1  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  33.1 
 
 
199 aa  68.9  3e-11  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31.69 
 
 
199 aa  68.6  3e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  32.39 
 
 
199 aa  68.6  3e-11  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31.69 
 
 
199 aa  68.6  3e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  32.62 
 
 
205 aa  67.8  5e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  34.06 
 
 
198 aa  67.8  5e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.5 
 
 
176 aa  67.8  6e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.55007e-09  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  31.69 
 
 
197 aa  67.8  6e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  31.69 
 
 
205 aa  67.4  6e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  30.99 
 
 
218 aa  67.4  7e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.43 
 
 
198 aa  67.4  8e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  32.39 
 
 
199 aa  66.6  1e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 
199 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  32.39 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  32.39 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  32.39 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  32.39 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  32.39 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  32.88 
 
 
200 aa  65.9  2e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  34.27 
 
 
199 aa  65.5  2e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 
200 aa  66.2  2e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.16 
 
 
212 aa  65.9  2e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  30.99 
 
 
199 aa  66.2  2e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
186 aa  65.5  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.78 
 
 
200 aa  65.5  3e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  28.67 
 
 
200 aa  65.5  3e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  30.82 
 
 
200 aa  65.5  3e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  33.33 
 
 
198 aa  65.5  3e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.69 
 
 
200 aa  65.5  3e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  65.5  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  29.53 
 
 
687 aa  64.7  4e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 
203 aa  65.1  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.77757e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
202 aa  64.7  4e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  30.14 
 
 
200 aa  64.7  5e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  30.99 
 
 
199 aa  64.3  6e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  30.99 
 
 
199 aa  64.3  6e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  28.97 
 
 
200 aa  63.9  7e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  32.19 
 
 
200 aa  63.9  7e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  32.19 
 
 
200 aa  64.3  7e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  32.19 
 
 
200 aa  63.9  8e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  30.5 
 
 
212 aa  63.9  8e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  29.71 
 
 
197 aa  63.5  9e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  29.71 
 
 
197 aa  63.5  9e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.99 
 
 
199 aa  63.9  9e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  34.78 
 
 
200 aa  63.5  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  29.03 
 
 
195 aa  63.5  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.37 
 
 
209 aa  63.2  1e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  29.45 
 
 
200 aa  63.2  2e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  30.38 
 
 
199 aa  62.4  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.14 
 
 
202 aa  62.4  2e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  29.58 
 
 
199 aa  62.8  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 
200 aa  61.6  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 
212 aa  62.4  3e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  32.19 
 
 
201 aa  62  3e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  31.69 
 
 
200 aa  62  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30.56 
 
 
200 aa  61.6  4e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  30.28 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  28.86 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  31.65 
 
 
202 aa  61.6  4e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  30.28 
 
 
199 aa  61.6  4e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  30.99 
 
 
199 aa  61.6  4e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.86 
 
 
206 aa  61.6  4e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  28.47 
 
 
200 aa  61.2  5e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.32 
 
 
199 aa  61.2  5e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  7.86086e-08 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  31.69 
 
 
202 aa  61.2  6e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  30 
 
 
199 aa  60.8  7e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>