More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1204 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  67.27 
 
 
666 aa  933  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  70.38 
 
 
665 aa  930  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 
697 aa  1394  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  67.43 
 
 
658 aa  903  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  88.35 
 
 
672 aa  1158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  65.96 
 
 
666 aa  880  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  47.47 
 
 
674 aa  608  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  45.58 
 
 
741 aa  577  1e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  45.96 
 
 
636 aa  571  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  43.81 
 
 
665 aa  538  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  45.36 
 
 
666 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.81 
 
 
671 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.43 
 
 
663 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  44.71 
 
 
672 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  40.66 
 
 
656 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  42.19 
 
 
666 aa  493  1e-138  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  43.07 
 
 
668 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  42.94 
 
 
664 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  39.73 
 
 
688 aa  469  1e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.04486e-09  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  39.12 
 
 
676 aa  455  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  38.31 
 
 
670 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  39.79 
 
 
682 aa  449  1e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 
664 aa  446  1e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  46.5 
 
 
577 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  38.05 
 
 
693 aa  406  1e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  41.54 
 
 
679 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  38.14 
 
 
585 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 
586 aa  363  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  40.21 
 
 
582 aa  360  6e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  37.95 
 
 
584 aa  359  8e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  38.38 
 
 
584 aa  359  9e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  32.99 
 
 
649 aa  357  4e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
649 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
667 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  32.49 
 
 
650 aa  350  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 
775 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 
673 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 
773 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 
671 aa  347  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.89 
 
 
680 aa  347  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  44.7 
 
 
457 aa  344  3e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.36 
 
 
720 aa  343  6e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
662 aa  343  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  32.99 
 
 
648 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  32.58 
 
 
648 aa  340  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  34.98 
 
 
659 aa  339  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  32.28 
 
 
648 aa  338  1e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 
771 aa  339  1e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.37 
 
 
648 aa  338  2e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  32.43 
 
 
648 aa  338  2e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.04 
 
 
762 aa  337  3e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.94 
 
 
648 aa  337  6e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.4 
 
 
567 aa  336  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  33.43 
 
 
648 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 
661 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  33.43 
 
 
648 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  32.58 
 
 
648 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  35.52 
 
 
567 aa  335  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 
674 aa  333  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 
660 aa  331  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  34.09 
 
 
661 aa  331  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 
661 aa  331  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  34.79 
 
 
652 aa  331  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
657 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 
674 aa  328  1e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
654 aa  327  4e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  32.89 
 
 
649 aa  327  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 
666 aa  326  8e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 
678 aa  326  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
667 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 
656 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.62 
 
 
669 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 
665 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 
665 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.47 
 
 
655 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 
567 aa  324  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  34.57 
 
 
660 aa  324  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  34.74 
 
 
669 aa  322  1e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.74 
 
 
669 aa  322  1e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.74 
 
 
669 aa  322  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  34.62 
 
 
663 aa  322  1e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  34.94 
 
 
663 aa  322  1e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.74 
 
 
669 aa  322  1e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.74 
 
 
669 aa  322  1e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 
667 aa  321  2e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  33.95 
 
 
668 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.28 
 
 
662 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 
661 aa  321  4e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 
652 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  34.3 
 
 
666 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 
668 aa  315  1e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 
668 aa  315  1e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 
668 aa  316  1e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  34.86 
 
 
661 aa  315  2e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
653 aa  314  3e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 
670 aa  314  3e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
670 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  35.23 
 
 
658 aa  310  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  32.62 
 
 
649 aa  310  6e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  30.45 
 
 
650 aa  310  6e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>