More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1164 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 387 aa  764    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  88.11 
 
 		 387 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  81.44 
 
 		 388 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  75.26 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  75 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  76.68 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  66.93 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  64.08 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  60.57 
 
 		 388 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  67.62 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  62.79 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  62.63 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  60.47 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  62.89 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  62.89 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  62.63 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  61.76 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  61.5 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  60.1 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.47 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  36.58 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.34 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  33.85 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  35.13 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  35.41 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  29.92 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.8 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.4 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.53 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.1 
 
 		 640 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.4 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.41 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.34 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  29.21 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  36.18 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  28.8 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  21.19 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.21 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  27.34 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  22.27 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.41 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.52 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.78 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  36.67 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.21 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  23.82 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.61 
 
 		 842 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.66 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  27.9 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  22.42 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.88 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.4 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  27.78 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  32.5 
 
 		 716 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  32.5 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.18 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  26.24 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  24.07 
 
 		 857 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  25.06 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  24.83 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.22 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  27.35 
 
 		 662 aa  66.6  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  28.28 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.36 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  26.34 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  28.74 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  31.88 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  22.78 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.46 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  26.69 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.88 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  27.24 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>