12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1087 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  203  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  73.58 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  60 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  56.38 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  56.38 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  36.04 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  31.19 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  27.96 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  24.47 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  24.42 
 
 		 104 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  23.47 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  24.51 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>