56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1071 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  95.1 
 
 
102 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  94.12 
 
 
102 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  93.14 
 
 
102 aa  200  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  88.24 
 
 
102 aa  193  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  83.17 
 
 
102 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  83.17 
 
 
102 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  81.19 
 
 
103 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  81.19 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  59.41 
 
 
102 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  59.8 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  60.78 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  58.82 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  54.55 
 
 
107 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  54.55 
 
 
107 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  29.7 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  38.1 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  36.84 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  31.18 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  30.21 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  30.53 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  27.06 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  30.1 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  32.29 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  34.04 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  26.73 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  27.66 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  32.99 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  29.76 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  24 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  28 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  22 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  24.18 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  30.93 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  29.13 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  26.04 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  21 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  31.31 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  32.97 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  26.67 
 
 
124 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  26.19 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3673  hypothetical protein  21 
 
 
113 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12005  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1671  hypothetical protein  21 
 
 
113 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>