More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1061 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  100 
 
 
398 aa  819    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  79.35 
 
 
397 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  78.28 
 
 
396 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  84.63 
 
 
397 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  77.47 
 
 
397 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  79.09 
 
 
397 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  78.48 
 
 
398 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  66.84 
 
 
396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  62.37 
 
 
397 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  61.77 
 
 
395 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  52.54 
 
 
397 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  53.08 
 
 
393 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  53.9 
 
 
395 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  52.53 
 
 
396 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 
393 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  46.03 
 
 
396 aa  359  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 
394 aa  358  7e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  46.1 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 
398 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 
395 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 
393 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  42.56 
 
 
398 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 
461 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  42.6 
 
 
398 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  42.6 
 
 
398 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  42.63 
 
 
400 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  41.05 
 
 
395 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.66 
 
 
394 aa  286  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  36.07 
 
 
393 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  36.51 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  35.62 
 
 
396 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  38.24 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.57 
 
 
405 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  35.31 
 
 
404 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
397 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  29.8 
 
 
403 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.44 
 
 
389 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  30.62 
 
 
389 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  30.62 
 
 
389 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  31.03 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 
375 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.57 
 
 
396 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  32.04 
 
 
402 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 
375 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.62 
 
 
404 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.36 
 
 
367 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  29.04 
 
 
375 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.92 
 
 
385 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  30.97 
 
 
368 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  27.9 
 
 
389 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.2 
 
 
396 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 
375 aa  151  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.05 
 
 
389 aa  151  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  30.27 
 
 
388 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.11 
 
 
395 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  29.95 
 
 
396 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.32 
 
 
370 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.12 
 
 
396 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  28.94 
 
 
396 aa  150  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  30.16 
 
 
403 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.97 
 
 
390 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  29.34 
 
 
396 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  29.34 
 
 
396 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  29.34 
 
 
396 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  29.34 
 
 
396 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.25 
 
 
377 aa  149  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 
377 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  29.72 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  28.85 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  29.72 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  27.78 
 
 
397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  29.34 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.14 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  28.84 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  28.1 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.11 
 
 
395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.11 
 
 
395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  27.91 
 
 
392 aa  147  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.67 
 
 
395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  29.85 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.38 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  32.08 
 
 
396 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  28.91 
 
 
397 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.07 
 
 
404 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 
392 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  29.92 
 
 
412 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  28.3 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  28.3 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  28.3 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  28.3 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  28.75 
 
 
387 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  27.7 
 
 
393 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  28.3 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 
398 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>