112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0948 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 399 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  68.09 
 
 		 400 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  67.25 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  66.58 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  63.32 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  44.61 
 
 		 377 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  44.89 
 
 		 380 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  43.64 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  43.42 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  43.42 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  43.42 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  43.49 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  43.18 
 
 		 397 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  42.11 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  42.43 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  42.54 
 
 		 399 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  42.54 
 
 		 399 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  40.45 
 
 		 397 aa  302  9e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  43.14 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  42.89 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  43.18 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  42.75 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  37.25 
 
 		 381 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  42.64 
 
 		 397 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  43.39 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  42.75 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  42.72 
 
 		 406 aa  282  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  41.15 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  44 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  40.8 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  37.34 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  23.54 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.53 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.91 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  22.8 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.67 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  23.02 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  23.02 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.08 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  23.02 
 
 		 354 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  22.43 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  23.28 
 
 		 354 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  23.04 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  22.7 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  22.7 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22.25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  22.03 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  23.84 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.89 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  21.85 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.72 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.74 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  28.18 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  20.48 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  24.13 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  21.39 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  20.53 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  21.99 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  21.99 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.03 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  20.44 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  20.44 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 355 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  22.76 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  21.2 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  22.96 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  31.96 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  31 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  22.22 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.55 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  25.23 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  20.85 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  25.89 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  21.83 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.11 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  19.52 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  34.67 
 
 		 779 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.1 
 
 		 662 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  25.45 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  28.49 
 
 		 779 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  28.83 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  24.28 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  20.12 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>