65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0900 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  67.09 
 
 		 313 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  56.55 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  50.79 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  48.88 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  44.48 
 
 		 312 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  35.17 
 
 		 700 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 		 727 aa  86.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  35.06 
 
 		 701 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  32.02 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  31.72 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  26.96 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  34.76 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  29.21 
 
 		 716 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  27.01 
 
 		 699 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  27.17 
 
 		 699 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  26.74 
 
 		 699 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  28.22 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  32.69 
 
 		 933 aa  76.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  26.44 
 
 		 704 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  30.82 
 
 		 709 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  30.12 
 
 		 702 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  26.44 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  26.44 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  26.74 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  26.59 
 
 		 705 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  30.12 
 
 		 702 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  26.44 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  30.82 
 
 		 701 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  25.81 
 
 		 726 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  24.83 
 
 		 722 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  21.89 
 
 		 747 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  24.36 
 
 		 696 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  39.34 
 
 		 59 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0456  methyltransferase type 11  24.05 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  40.98 
 
 		 62 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  35.59 
 
 		 89 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  39.34 
 
 		 60 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1369  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  38.98 
 
 		 58 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  41.54 
 
 		 71 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  39.62 
 
 		 55 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.6 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  20.79 
 
 		 703 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  36.21 
 
 		 55 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  36.21 
 
 		 64 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2080  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.517961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  37.93 
 
 		 64 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  39.66 
 
 		 59 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>