More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0884 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 510 aa  1036    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  59.14 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  47.27 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  46.23 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 434 aa  359  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  44.84 
 
 		 443 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  44.18 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 		 446 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 400 aa  169  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 447 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 454 aa  127  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 454 aa  127  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 442 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 442 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 449 aa  120  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.35 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 447 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.32 
 
 		 459 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.29 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 442 aa  95.9  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 450 aa  93.6  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  24.13 
 
 		 452 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 351 aa  87.4  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 447 aa  86.7  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  28.36 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  33.7 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.48 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.48 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.21 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.05 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.97 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.97 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  32.02 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.9 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  33.95 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  27.5 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  32.84 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.94 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.53 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  28.41 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  21.1 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  32.57 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1799  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.63 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.125674  normal  0.916048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>