More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0870 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  100 
 
 
137 aa  274  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  75.91 
 
 
137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  44.03 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
129 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  43.59 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
136 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
154 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  41.13 
 
 
329 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  41.13 
 
 
329 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.67 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  37.07 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.66 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.8 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  36.07 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40.98 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.98 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.17 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  35.48 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.93 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.93 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.93 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.61 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  35.83 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  35.54 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  32.43 
 
 
352 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  31.71 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.84 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.65 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.17 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  36.61 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.29 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  28.79 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  34.45 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  35 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  34.82 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.3 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  31.67 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.53 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  31.67 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.17 
 
 
347 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.33 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.78 
 
 
373 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.19 
 
 
352 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  33.91 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.38 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.5 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.53 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  34.71 
 
 
434 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  35.78 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  35.78 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  34.09 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  33.04 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  30 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.66 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  34.09 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  27.27 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  32.54 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.66 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>