More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0817 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  87.16 
 
 		 257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  81.35 
 
 		 256 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  75.78 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  74.6 
 
 		 256 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  59.14 
 
 		 269 aa  298  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  57.09 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  61.09 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  53.26 
 
 		 270 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  57.79 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  55.29 
 
 		 263 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  49.6 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  50.58 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  53.11 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  45.35 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  46.88 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  51.6 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  51.6 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  51.6 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  51.6 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  51.14 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  51.14 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  51.14 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  50.23 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  46.88 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  44.36 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  45.42 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  45.02 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  44.75 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  44.36 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  43.7 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  44.53 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  42.63 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  46.27 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  43.65 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  46.27 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  43.65 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  46.27 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  47.08 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  44.36 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  44.75 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  42.8 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  48.6 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  45.56 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  43.75 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  45.17 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  48.84 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  43.58 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  43.58 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  47.75 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  43.58 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  43.58 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  43.97 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  45.7 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  45.59 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  46.96 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  45.59 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  45.59 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  49.53 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  44.36 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  44.36 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  43.02 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  49.14 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  44.44 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  47.3 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  49.07 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  43.85 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  50.94 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  48.6 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  47.25 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  42.8 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  46.58 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  49.53 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  49.53 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  44.14 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  47.73 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  47.2 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  43.58 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  43.24 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  44.14 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  44.14 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  44.14 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  50.71 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  44.06 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  48.36 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  44.14 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  43.36 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  42.8 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  41.54 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  46.06 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  42.97 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  52.05 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  46.3 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>