75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0767 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  62.5 
 
 		 219 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  62.39 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  54.67 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  51.11 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  46.49 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  31.72 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  32.46 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  28.91 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  31.44 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  30.6 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  33.63 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  31.14 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  28.12 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  30.59 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  31.61 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  29.11 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  29.03 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  27.05 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  27.75 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.36 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  29.39 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  28.76 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  25.6 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  30.54 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  26.79 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  27.75 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  25.61 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  26.95 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  28.36 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.05 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  32.52 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  26.7 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  32.65 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  26.79 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  34 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4796  hypothetical protein  26.34 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  26.07 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 		 359 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 		 373 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  37.21 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  37.21 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  31.65 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1447  outer surface protein  29.8 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  28.77 
 
 		 340 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  25 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  29.87 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  28.4 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  28.4 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  29.87 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  25.96 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  25.84 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  25.96 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  25.96 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  25.96 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  32.8 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  29.24 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  29.24 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  32.56 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  26.85 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  27.93 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  29.86 
 
 		 373 aa  45.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  31.43 
 
 		 280 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  35.23 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  28.19 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  29.6 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2971  hypothetical protein  31.18 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  30.86 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  27.06 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  37.35 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3602  outer surface protein  31.2 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0165827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  29 
 
 		 290 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12641  hypothetical protein  25.99 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.536745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>