More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0684 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  100 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  95.73 
 
 		 164 aa  315  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  92.68 
 
 		 164 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  70.73 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  71.34 
 
 		 164 aa  231  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  67.5 
 
 		 163 aa  224  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  67.31 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  66.88 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  62.8 
 
 		 164 aa  213  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  62.8 
 
 		 164 aa  213  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  64.43 
 
 		 162 aa  204  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  58.97 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  56.69 
 
 		 171 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  53.7 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  56.67 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  54.49 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  58.55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  54.43 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  51.28 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  52.32 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  51.3 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  50.98 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  44.87 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  50.62 
 
 		 185 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  50.34 
 
 		 169 aa  157  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  46.84 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  49.02 
 
 		 194 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  49.02 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  49.02 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  41.72 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  47.89 
 
 		 179 aa  143  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  42.5 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  41.88 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  42.04 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  42.11 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  45.22 
 
 		 171 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  47.33 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  44.37 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  45.21 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  45.65 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  40.56 
 
 		 183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  39.33 
 
 		 212 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  49.24 
 
 		 194 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.51 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  43.87 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  39.86 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  43.87 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  37.34 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  42.47 
 
 		 205 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  37.82 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  44 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  39.22 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  48.85 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  48.85 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  43.26 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  40.91 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  42.75 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  39.24 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  39.24 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  38.78 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  44.08 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  38.51 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  38.46 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  38.31 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.16 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  40.97 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38.96 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  38.99 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  39.87 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.39 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.94 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  40.56 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.34 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  41.84 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.37 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  41.18 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.11 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.11 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.11 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.11 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  38.1 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  38 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  39.16 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  36.77 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  37.5 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.04 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  38.31 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  37.65 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  36.42 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  36.94 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  37.5 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  34.62 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  37.65 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  39.33 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  37.24 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  39.33 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.42 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  37.93 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  38 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>