More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0648 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  91.53 
 
 
118 aa  223  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 
118 aa  209  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 
118 aa  209  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  87.18 
 
 
118 aa  209  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  84.75 
 
 
119 aa  205  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  81.74 
 
 
119 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  74.34 
 
 
115 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 
121 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  61.02 
 
 
118 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  63.72 
 
 
117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  62.83 
 
 
118 aa  164  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
118 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
118 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  62.83 
 
 
121 aa  160  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  62.71 
 
 
118 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  67.27 
 
 
116 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  62.83 
 
 
116 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
115 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  61.06 
 
 
119 aa  158  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  158  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 
118 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
115 aa  157  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 
114 aa  157  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  157  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 
119 aa  156  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
113 aa  155  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 
120 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  59.29 
 
 
117 aa  154  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 
115 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  154  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  65.25 
 
 
130 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 
114 aa  154  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  59.83 
 
 
119 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
113 aa  153  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
119 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  60.87 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 
129 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
113 aa  151  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 
116 aa  150  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  60.18 
 
 
124 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 
127 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 
116 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 
126 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
118 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 
131 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
118 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
114 aa  148  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 
116 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
116 aa  147  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 
126 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 
117 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  56.64 
 
 
120 aa  146  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  146  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  59.32 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  60.17 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  57.27 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.29 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  58.41 
 
 
117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  66.33 
 
 
119 aa  144  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  62.5 
 
 
114 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  62.5 
 
 
114 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  59.26 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
113 aa  144  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 
180 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
114 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 
177 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 
166 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
134 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
117 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  61.47 
 
 
116 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
115 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
134 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
132 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  53.98 
 
 
113 aa  142  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  60.36 
 
 
114 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  54.47 
 
 
183 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  60.55 
 
 
116 aa  141  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 
116 aa  141  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  58.77 
 
 
114 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
130 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  54.47 
 
 
184 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>