More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0634 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
398 aa  796    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  62.66 
 
 
400 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  61.65 
 
 
400 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1419  glycosyl transferase, group 1 family protein  54.77 
 
 
396 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  44.67 
 
 
388 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  43.77 
 
 
386 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  41.19 
 
 
428 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4880  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
393 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
399 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
409 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  33.96 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  23 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  32.1 
 
 
557 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  29.97 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.96 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
575 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  28.61 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  33.33 
 
 
601 aa  74.7  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  21.55 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  32.26 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  31.15 
 
 
564 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  45.24 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.6 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.38 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.52 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.35 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  26.16 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  21.31 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.41 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  32.44 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.18 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.32 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  38.38 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
787 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>