More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0631 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
321 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 
311 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
313 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  43 
 
 
348 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 
350 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
303 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
306 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 
334 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
334 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
315 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
309 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.05 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.94 
 
 
241 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.15 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  40.72 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
312 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
242 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.17 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  28.44 
 
 
332 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
338 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  34.25 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
334 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  31.53 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
247 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  34.02 
 
 
339 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
354 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 
313 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
310 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
342 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  36.12 
 
 
1171 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  26.2 
 
 
313 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
256 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
254 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
310 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
390 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
347 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.27 
 
 
294 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
376 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.09 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  26.09 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
336 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.53 
 
 
337 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
373 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.91 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
344 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
703 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1070  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0299214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
455 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.52 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
581 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
596 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
597 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.44 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  44.12 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.07 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0704  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
462 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439605  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>