145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0613 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  100 
 
 		 454 aa  932    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  77.31 
 
 		 452 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  65.71 
 
 		 453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  61.71 
 
 		 452 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  61.93 
 
 		 452 aa  551  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  55.02 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  48.16 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  43.1 
 
 		 461 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  35.1 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  37.94 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  34.05 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  29.89 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  28.93 
 
 		 535 aa  191  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  28.33 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  28.45 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  29.34 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  26.04 
 
 		 554 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2291  ResB family protein  27.83 
 
 		 458 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  25.54 
 
 		 511 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  26.56 
 
 		 461 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  26.56 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  29.34 
 
 		 719 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  24.85 
 
 		 553 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  27.37 
 
 		 718 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  26.6 
 
 		 738 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  27.37 
 
 		 718 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1599  resB protein  25.2 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85607  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  27.37 
 
 		 718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  27.37 
 
 		 718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  27.37 
 
 		 725 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  27.37 
 
 		 725 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  25.73 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  24.85 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  25.3 
 
 		 542 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1384  resB protein  24.7 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.615548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1495  resB protein  24.7 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0300  ResB family protein  27.25 
 
 		 740 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1567  resB protein  24.7 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70106e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1397  ResB family protein  25.05 
 
 		 538 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3824  ResB-like  26.41 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0309  ResB family protein  26.98 
 
 		 738 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116353  normal  0.247341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1357  cytochrome c biogenesis protein  24.9 
 
 		 541 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  26.34 
 
 		 737 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  26.34 
 
 		 737 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  24.24 
 
 		 541 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  26.34 
 
 		 737 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1635  resB protein  24.44 
 
 		 541 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  25.84 
 
 		 457 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1356  cytochrome c biogenesis protein  24.03 
 
 		 541 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0282  ResB family protein  28.7 
 
 		 738 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.877931  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0233  ResB-like protein  28.1 
 
 		 660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.96355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  26.11 
 
 		 737 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  27.12 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  26.44 
 
 		 740 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  27.66 
 
 		 741 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  26.17 
 
 		 670 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.5 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.25 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  27.36 
 
 		 733 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  25.94 
 
 		 734 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0048  ResB-like  28.49 
 
 		 664 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000246708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0627  ResB-like  22.78 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305133  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  27.86 
 
 		 701 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.93 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.58 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  28.21 
 
 		 750 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  25.94 
 
 		 734 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  24.86 
 
 		 694 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0090  ResB family protein  26.65 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  25.81 
 
 		 678 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0530  ResB family protein  23.87 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.82 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  25.67 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  27.65 
 
 		 742 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.66 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  22.55 
 
 		 522 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  24.06 
 
 		 700 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2986  putative cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  27.38 
 
 		 700 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.23 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3112  cytochrome c-type biogenesis protein ResB  24.44 
 
 		 614 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2710  ResB family protein  24.44 
 
 		 614 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000254674  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27799  chloroplast cytochrome c biogenesis protein, Ccs1-like protein  23.78 
 
 		 448 aa  86.7  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.18 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0773  ResB-like  23.96 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  23.81 
 
 		 717 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  23.81 
 
 		 717 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0433  putative cytochrome c-type biogenesis transmembrane protein  23.03 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265528  normal  0.13422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  21.01 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.54 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1895  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  27.11 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.541938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  23.82 
 
 		 727 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4838  ResB family protein  22.09 
 
 		 724 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  24.53 
 
 		 732 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  24.7 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2204  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.45 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  23.89 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1490  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  22.62 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  22.16 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  25.24 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  25.86 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>