50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0594 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  100 
 
 		 349 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  75.71 
 
 		 350 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  54.5 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  54.72 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  49.13 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  48.73 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  25.33 
 
 		 471 aa  89.7  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  29.55 
 
 		 619 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  29.31 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  30.77 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  28.99 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  30.19 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  29.56 
 
 		 616 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  28.49 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 266 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  30 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  30.49 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  34.02 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.22 
 
 		 729 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  30.48 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  29.05 
 
 		 154 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  26.17 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  32.12 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02726  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.65 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  33.33 
 
 		 487 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  29.05 
 
 		 154 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  30.63 
 
 		 200 aa  46.2  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  29.05 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  26.16 
 
 		 708 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  26.51 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  26.11 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  25 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  30.37 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  30.32 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  30.46 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  23.53 
 
 		 688 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  32 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  32.97 
 
 		 809 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  31.85 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  29.55 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  28.31 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.37 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  25.81 
 
 		 154 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  27.08 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  28.09 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  28 
 
 		 337 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  29.51 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  29.59 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>