264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0578 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
292 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  97.25 
 
 
291 aa  594  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.70309e-08  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  94.14 
 
 
292 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  94.48 
 
 
291 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  93.13 
 
 
291 aa  576  1e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  92.41 
 
 
292 aa  571  1e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  91.03 
 
 
291 aa  562  1e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.08 
 
 
290 aa  530  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.49594e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.96 
 
 
296 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.66 
 
 
319 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.57 
 
 
296 aa  464  1e-130  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.57 
 
 
303 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.39 
 
 
321 aa  461  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.41 
 
 
295 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.59349e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.79 
 
 
291 aa  459  1e-128  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.65 
 
 
290 aa  459  1e-128  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.07 
 
 
294 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  1.6391e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.41 
 
 
295 aa  454  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  71.08 
 
 
301 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.92 
 
 
289 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.92 
 
 
308 aa  446  1e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.48 
 
 
291 aa  447  1e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.86 
 
 
300 aa  441  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.78 
 
 
309 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.88 
 
 
292 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.08 
 
 
326 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.78 
 
 
309 aa  440  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.78 
 
 
309 aa  440  1e-122  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.58 
 
 
312 aa  438  1e-122  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.79 
 
 
297 aa  438  1e-122  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.62 
 
 
294 aa  434  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.58 
 
 
308 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.18 
 
 
325 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.88 
 
 
301 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  70.14 
 
 
290 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.9 
 
 
364 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.42 
 
 
308 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.34 
 
 
314 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4336  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.82 
 
 
294 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
317 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.18 
 
 
314 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.55 
 
 
315 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.76 
 
 
306 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.9 
 
 
315 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.31 
 
 
350 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.66 
 
 
329 aa  428  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.48 
 
 
298 aa  427  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.83 
 
 
301 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.15 
 
 
309 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.37 
 
 
327 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
289 aa  427  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
317 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
296 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.36 
 
 
292 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  4.72181e-05  hitchhiker  2.90022e-10 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.72 
 
 
312 aa  424  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.83 
 
 
317 aa  424  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
315 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
315 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  1.12208e-10 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.36 
 
 
294 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.55 
 
 
315 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
290 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.31 
 
 
317 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.99 
 
 
290 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  69.66 
 
 
293 aa  426  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.55 
 
 
318 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.2 
 
 
315 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.78016e-07 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
290 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.86 
 
 
315 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  8.95825e-12 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  68.06 
 
 
289 aa  424  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3371  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  69.55 
 
 
333 aa  421  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00416718  normal  0.205184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.28 
 
 
299 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.32 
 
 
294 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  68.97 
 
 
308 aa  422  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.51 
 
 
335 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
318 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  68.86 
 
 
315 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.76 
 
 
317 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.73 
 
 
301 aa  421  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.14 
 
 
317 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.94 
 
 
301 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.31 
 
 
282 aa  417  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.66 
 
 
304 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.55 
 
 
301 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.94 
 
 
301 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0922  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.21 
 
 
292 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  4.02813e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0551  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.02 
 
 
301 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.94 
 
 
301 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.39617e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.94 
 
 
301 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.32 
 
 
296 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
312 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0026  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.62 
 
 
301 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0127788 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.21 
 
 
335 aa  415  1e-115  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.74 
 
 
328 aa  415  1e-115  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.28 
 
 
301 aa  416  1e-115  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0015  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.6 
 
 
301 aa  416  1e-115  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0585  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.21 
 
 
390 aa  415  1e-115  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0702  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.21 
 
 
335 aa  415  1e-115  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.88 
 
 
334 aa  416  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.75 
 
 
319 aa  415  1e-115  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.21 
 
 
335 aa  415  1e-115  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>