18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0551 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  4e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  84.96 
 
 
113 aa  200  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  84.07 
 
 
113 aa  198  2e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  64.6 
 
 
114 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  51.33 
 
 
115 aa  131  4e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  54.78 
 
 
115 aa  119  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  48.72 
 
 
113 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  47.86 
 
 
113 aa  116  1e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  51.3 
 
 
115 aa  112  1e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  38.18 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  38.33 
 
 
118 aa  83.2  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  43.3 
 
 
110 aa  77  8e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  40.74 
 
 
127 aa  61.6  4e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  30.97 
 
 
134 aa  50.1  1e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  29.27 
 
 
120 aa  47.4  7e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  5.80905e-14 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  29.27 
 
 
120 aa  47  9e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  31.65 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  35.94 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>