74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0512 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1090    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  57.61 
 
 		 546 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  47.79 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  43.66 
 
 		 545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  38.2 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  35.62 
 
 		 534 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 538 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  31.52 
 
 		 541 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  33.41 
 
 		 556 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  31.21 
 
 		 611 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  29.25 
 
 		 622 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  32.68 
 
 		 562 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  28.48 
 
 		 547 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  30.96 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  31.38 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  30.26 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  31.94 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  31.94 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  31.94 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  31.47 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  31.34 
 
 		 556 aa  194  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  31.47 
 
 		 563 aa  193  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  31.7 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  31.47 
 
 		 563 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 542 aa  193  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  32.92 
 
 		 555 aa  189  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  31.62 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  30.41 
 
 		 556 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  31.5 
 
 		 555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  26.74 
 
 		 562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  30.46 
 
 		 563 aa  183  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  28.9 
 
 		 556 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  30.19 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  26.59 
 
 		 562 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  24.49 
 
 		 559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  25.41 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  24.58 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  26.08 
 
 		 660 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  27.27 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  25.97 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  25.92 
 
 		 566 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  28.42 
 
 		 656 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  30.53 
 
 		 530 aa  156  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  26.3 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  26.36 
 
 		 462 aa  143  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  32.39 
 
 		 527 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  25.87 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  36 
 
 		 691 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  26.49 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  27.53 
 
 		 520 aa  123  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  27.91 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  25.92 
 
 		 484 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  26.16 
 
 		 629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  28.66 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  28.11 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  23.63 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  23.58 
 
 		 529 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  25.97 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  28.92 
 
 		 578 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  24.94 
 
 		 653 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  23.39 
 
 		 634 aa  96.7  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  27.01 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  25.72 
 
 		 381 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  28.17 
 
 		 603 aa  90.9  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  26.32 
 
 		 728 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  30.32 
 
 		 543 aa  87.8  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  28.28 
 
 		 509 aa  87.4  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  33.18 
 
 		 603 aa  87  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  26.27 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  27.84 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  29.25 
 
 		 598 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000308473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2318  hypothetical protein  23.72 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575561 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1150  hypothetical protein  25.64 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>