More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0505 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  62.94 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  48.78 
 
 		 167 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  47.8 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  48.43 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  39.39 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  38.84 
 
 		 252 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 		 147 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 406 aa  71.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.43 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  31.96 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 380 aa  64.3  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.92 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  38.78 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.02 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  37.23 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.37 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.61 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.34 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  32.48 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 480 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  33.03 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.73 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  27.62 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  33.03 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28.21 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  28.21 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 377 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  31.31 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  33.68 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  32.76 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.37 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 125 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  35.37 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.39 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>