More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0488 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  100 
 
 		 316 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  86.62 
 
 		 316 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  85.08 
 
 		 316 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  82.54 
 
 		 316 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  82.54 
 
 		 316 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  77.02 
 
 		 317 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  76.34 
 
 		 318 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  73.89 
 
 		 317 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  75.24 
 
 		 316 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  77.17 
 
 		 318 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  73.65 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  73.89 
 
 		 319 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  75.08 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  74.29 
 
 		 317 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  74.04 
 
 		 316 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  72.76 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  70.57 
 
 		 319 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  73.95 
 
 		 320 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  73.14 
 
 		 319 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  72.76 
 
 		 316 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 320 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  73.31 
 
 		 320 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  72.76 
 
 		 317 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  71.75 
 
 		 345 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  72.03 
 
 		 322 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  71.92 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  72.03 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 320 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  72.03 
 
 		 322 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  72.03 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  72.76 
 
 		 316 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 320 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  72.35 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 320 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  74.43 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  72.67 
 
 		 321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  69.84 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 321 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  72.76 
 
 		 316 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  70.74 
 
 		 319 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  71.34 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  70.19 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  70.98 
 
 		 328 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2486  thioredoxin reductase  70.51 
 
 		 318 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000100803  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  71.38 
 
 		 332 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  70.83 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000669147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  71.52 
 
 		 318 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  72.03 
 
 		 333 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  73.08 
 
 		 317 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  71.61 
 
 		 318 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  70.83 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  70.83 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  71.79 
 
 		 321 aa  464  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  69.52 
 
 		 317 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  71.38 
 
 		 318 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  72.12 
 
 		 321 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  71.38 
 
 		 319 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  69.52 
 
 		 317 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  71.25 
 
 		 318 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  70.74 
 
 		 342 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  71.34 
 
 		 320 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000679645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  74.11 
 
 		 315 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000099736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  71.79 
 
 		 321 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  69.75 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  69.21 
 
 		 317 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  71.47 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  70.7 
 
 		 319 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  69.21 
 
 		 317 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  72.35 
 
 		 320 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  70.29 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  70.29 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  71.29 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  71.29 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  69.84 
 
 		 337 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  70.83 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  70.74 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  70.29 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2326  thioredoxin reductase  68.89 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000028573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  70.29 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  70.32 
 
 		 316 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  70.74 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  70.29 
 
 		 320 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  70.87 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>