More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0487 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  100 
 
 
331 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  78.95 
 
 
334 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  74.02 
 
 
326 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  73.18 
 
 
341 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  71.85 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  63.42 
 
 
309 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  60.39 
 
 
309 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  47.64 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  43.18 
 
 
317 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 
342 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 
307 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
311 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  41.67 
 
 
299 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  43.54 
 
 
315 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  41.78 
 
 
317 aa  212  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.29 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 
312 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 
326 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  37.06 
 
 
298 aa  209  7e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 
316 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.5 
 
 
299 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.79 
 
 
299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  39.26 
 
 
295 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.52 
 
 
299 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.89 
 
 
299 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.15 
 
 
299 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.89 
 
 
299 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  35.23 
 
 
312 aa  202  9e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  40.49 
 
 
312 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.89 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.89 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.86 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 
311 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  41.3 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.29 
 
 
304 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  38.24 
 
 
301 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 
301 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  35.94 
 
 
306 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 
301 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 
301 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  38.91 
 
 
314 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 
327 aa  193  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 
325 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  40.59 
 
 
305 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  40.44 
 
 
305 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
319 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
319 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40.73 
 
 
316 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40.73 
 
 
316 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 
306 aa  185  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.54 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  34.59 
 
 
310 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  34.84 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.32 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.32 
 
 
297 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 
342 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.33 
 
 
298 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 
305 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 
298 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 
300 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 
302 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 
310 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
284 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
298 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 
398 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
323 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 
340 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 
324 aa  175  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 
306 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 
284 aa  175  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  37.02 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.35 
 
 
312 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 
322 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 
322 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 
319 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 
342 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  34.24 
 
 
321 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 
316 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  35.93 
 
 
312 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
342 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>