More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0479 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 463 aa  928    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  72.73 
 
 		 466 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  86.61 
 
 		 469 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  73.65 
 
 		 467 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  72.29 
 
 		 466 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  67.6 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  57.61 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 477 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 477 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 		 477 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  54.13 
 
 		 477 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 477 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  54.13 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  53.91 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 477 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  53.91 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  55.9 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  53.48 
 
 		 477 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 479 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  54.08 
 
 		 479 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  54.29 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  54.25 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  54.25 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  54.25 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  54.64 
 
 		 476 aa  498  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  51.83 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 476 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 479 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  53.98 
 
 		 468 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  54.27 
 
 		 476 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  53.81 
 
 		 476 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  54.08 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 476 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  53.81 
 
 		 476 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  50.98 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  53.81 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  53.86 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  53.61 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  53.42 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  56.67 
 
 		 475 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  54.01 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  58.08 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  52.99 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  56.46 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 		 485 aa  458  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  55.16 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.96 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  56.24 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 		 505 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  49.24 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  50.77 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  50.11 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  51.95 
 
 		 521 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  47.61 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  52.72 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  47.19 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  47.19 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 483 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  47.19 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  49.45 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  50.43 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  46.32 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  50 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  48.36 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>