279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0422 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 101 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  92.08 
 
 		 101 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  86.14 
 
 		 99 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  85.42 
 
 		 99 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  85.26 
 
 		 103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  88.24 
 
 		 101 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  88.24 
 
 		 101 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  69.41 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  68.24 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  69.41 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  67.06 
 
 		 188 aa  124  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  67.06 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  56 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  62.92 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  60.2 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  62.92 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  64.71 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  62.35 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  61.18 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  63.53 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  53.4 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  61.18 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  59.77 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  59.77 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  56.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  66.27 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  62.65 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  59.77 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  61.18 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  56.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  56.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  63.41 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  61.18 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  71.05 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  55.56 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  62.35 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  51.55 
 
 		 375 aa  114  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  62.65 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  56.98 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  60 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  56.12 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  60 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  58.62 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  51 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 226 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  59.55 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  59.55 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  60 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  57.83 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  52.08 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  60.71 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  59.52 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  60.71 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  57.83 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  57.83 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  55.42 
 
 		 402 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  63.41 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  51.55 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.58 
 
 		 346 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  63.41 
 
 		 109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  52.58 
 
 		 346 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  49.48 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  49 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  50.51 
 
 		 401 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  53.57 
 
 		 175 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  55.81 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  54.76 
 
 		 406 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  47.01 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  53.57 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  52.69 
 
 		 378 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  49.49 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  54.55 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  55.81 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  49.48 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  54.76 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  57.32 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  53.12 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  49.48 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  57.32 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>