29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0416 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  950  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  41.16 
 
 
479 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  39.02 
 
 
656 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  35.89 
 
 
604 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  42.68 
 
 
660 aa  117  4e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  33.52 
 
 
570 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  42.68 
 
 
602 aa  73.6  8e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  29.27 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  32.89 
 
 
438 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  35.71 
 
 
390 aa  47  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  31.71 
 
 
512 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  31 
 
 
351 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2009  flagellar hook-length control protein  25 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  32.79 
 
 
408 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  45.45 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  27.83 
 
 
491 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  32.79 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  32.79 
 
 
428 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2039  flagellar hook-length control protein  25.47 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  25.83 
 
 
383 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  31.08 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  37.7 
 
 
567 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  26.21 
 
 
453 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  38.71 
 
 
474 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  31.87 
 
 
352 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2770  flagellar hook-length control protein FliK  29.08 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.131084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  28.71 
 
 
579 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>