More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0399 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 91 aa  183  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  63.1 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  47.44 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 92 aa  87  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.04 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  34.44 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  39.76 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  42.31 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  39.47 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  35.16 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  40.85 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  40.28 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  30 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>