More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0369 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3161  FlhB domain-containing protein  78.65 
 
 
94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  66.67 
 
 
108 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  69.62 
 
 
91 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2369  flagellar protein FhlB-like protein  67.47 
 
 
94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  68.24 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  62.5 
 
 
101 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  67.44 
 
 
93 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  65 
 
 
92 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  65.82 
 
 
100 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2951  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  57.14 
 
 
150 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2137  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  57.14 
 
 
127 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.406507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  61.45 
 
 
93 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  60.49 
 
 
102 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4161  flagellar biosynthesis protein  57.78 
 
 
97 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0421  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  58.24 
 
 
105 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0303064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0227  putative flagellar biosynthesis protein  58.24 
 
 
105 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0239  putative flagellar biosynthesis protein  58.24 
 
 
105 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  65.38 
 
 
114 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0205  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  59.77 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3056  putative flagellar protein FhlB  57.45 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3104  putative flagellar protein FhlB  57.83 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3286  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  60 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3395  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  60 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2970  putative flagellar protein FhlB  57.83 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0147408  normal  0.125746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0171  flagellar biosynthetic protein FlhB  56.32 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2445  putative flagellar protein FhlB  55.56 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3059  putative flagellar protein FhlB  55.56 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3078  putative flagellar protein FhlB  55.56 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1596  flagellar protein FhlB  56.47 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2926  flagellar biosynthetic protein FlhB  58.82 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6408  putative flagellar protein FhlB  54.44 
 
 
105 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.15037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2029  flagellar protein FhlB-like protein  52.22 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24290  flagellar protein  61.54 
 
 
94 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3765  flagellar biosynthetic protein FlhB  56.25 
 
 
119 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.943439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  47.67 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  46.34 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  46.67 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  46.99 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  48.28 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  45.24 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  45.57 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  43.9 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  46.25 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  45 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  49.4 
 
 
89 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  42.53 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  40.24 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  43.75 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  43.59 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  40.24 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  52.05 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  44.71 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1760  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  47.62 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000598623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  39.29 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  41.03 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  41.03 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  41.03 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  38.75 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  39.02 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  37.93 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  39.53 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  52.63 
 
 
374 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  50.65 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  45.68 
 
 
363 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  44.16 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  48 
 
 
350 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  43.9 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  41.67 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  43.59 
 
 
107 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  47.37 
 
 
379 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  44.3 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  43.02 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  40.48 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  41.38 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  40.48 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  40.51 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  40.51 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.16 
 
 
387 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  43.68 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  40.96 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  43.59 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  44.16 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  43.59 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  35.44 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2827  hypothetical protein  43.68 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  50.65 
 
 
366 aa  60.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  41.46 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  42.86 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  46.34 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  39.29 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  40.79 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>