More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0367 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  100 
 
 		 305 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  75.08 
 
 		 310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  67.67 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  65.33 
 
 		 311 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  63.42 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  61.2 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  57.89 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  55.96 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  52 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  48.67 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  48.5 
 
 		 304 aa  295  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  49.34 
 
 		 307 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  45.03 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  45.21 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  45.61 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  48 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  43.23 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  41.95 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  43.05 
 
 		 311 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  43.05 
 
 		 311 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  47.19 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  43.43 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  43.43 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  43.43 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  41.33 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  43.43 
 
 		 319 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  41.33 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  43.77 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  43.77 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  43.43 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  43.1 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  43.43 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  43.43 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  43.1 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  44.08 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  43.67 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  41.64 
 
 		 314 aa  268  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  45.15 
 
 		 318 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  43.71 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  44.88 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  42.95 
 
 		 313 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  44.88 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  44.22 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  40.46 
 
 		 311 aa  255  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  44.48 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  39.8 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  44.15 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  45.15 
 
 		 372 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  40.13 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  39.22 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  39.22 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  39.22 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  39.22 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  39.22 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  38.56 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  38.56 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  38.56 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  38.56 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  38.46 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  38.56 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  38.56 
 
 		 320 aa  235  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  38.56 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  38.56 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  44.63 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  38.56 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  38.93 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  39.14 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  37.91 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  40.59 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  38.38 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  38.38 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  38.44 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  40.14 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  38.05 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  35.97 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  38.68 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  36.7 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  39.6 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  39.93 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  39.6 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  36.54 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1403  hypothetical protein  35.55 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0317074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  38.61 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  38.68 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  38.59 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  42.61 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  36.67 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  38.8 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0165  hypothetical protein  36.86 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.375388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  36.3 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  38.93 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  40.91 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  36.63 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  40.56 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  40.21 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2223  hypothetical protein  43.33 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  37.42 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1005  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  36.75 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  38.6 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>