More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0360 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  57.05 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  48.4 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.96 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.34 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  43.3 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 459 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.45 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  55.94 
 
 		 428 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.1 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  53.47 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.68 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  33.64 
 
 		 345 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  52.79 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  52.22 
 
 		 466 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.72 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.52 
 
 		 335 aa  183  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  31.96 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  31.96 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.7 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  51.4 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  56.38 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  56.38 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  56.38 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  55.03 
 
 		 344 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  55.03 
 
 		 344 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  36.39 
 
 		 290 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  31.19 
 
 		 333 aa  163  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  53.42 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  53.95 
 
 		 376 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.89 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  32.27 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  55.26 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  42.65 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.2 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  51.85 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.45 
 
 		 544 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  41.21 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.58 
 
 		 542 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  45.93 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 543 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1987 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.91 
 
 		 623 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  50.34 
 
 		 209 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  51.39 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  51.75 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  40.98 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  60.19 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  44.34 
 
 		 320 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  58.33 
 
 		 333 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  48.92 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.55 
 
 		 374 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  55.75 
 
 		 210 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  35.38 
 
 		 486 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  27.91 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  47.5 
 
 		 266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  39.91 
 
 		 727 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.37 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  51.72 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  57.8 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.86 
 
 		 1755 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  25.85 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  46.41 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  43.84 
 
 		 368 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.42 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  52.21 
 
 		 314 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  31.05 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.85 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.8 
 
 		 1264 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  49.55 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.61 
 
 		 240 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  37.64 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  47.46 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.33 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  48.63 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  45.65 
 
 		 218 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  31.79 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  56.86 
 
 		 1707 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 359 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  46.58 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 237 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  40 
 
 		 201 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  41.45 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>