More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0344 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  100 
 
 
826 aa  1701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  68.64 
 
 
821 aa  1129    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  72.41 
 
 
828 aa  1251    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  72.17 
 
 
828 aa  1260    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  68.28 
 
 
821 aa  1144    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  61.06 
 
 
815 aa  1002    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.63 
 
 
898 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 
917 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  37.07 
 
 
899 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.05 
 
 
893 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.46 
 
 
893 aa  542  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.24 
 
 
900 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.6 
 
 
893 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  36.48 
 
 
831 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.18 
 
 
904 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  35.39 
 
 
844 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.3 
 
 
900 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  36.59 
 
 
843 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  36.77 
 
 
822 aa  502  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  35.53 
 
 
822 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  35.08 
 
 
879 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.45 
 
 
901 aa  469  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 
905 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  35.05 
 
 
808 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 
886 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.52 
 
 
903 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.44 
 
 
920 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.62 
 
 
947 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  33.49 
 
 
850 aa  439  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.48 
 
 
923 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.55 
 
 
984 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 
984 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 
984 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 
984 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.66 
 
 
984 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.77 
 
 
984 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.67 
 
 
984 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 
984 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 
982 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.33 
 
 
982 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.58 
 
 
911 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.48 
 
 
1000 aa  429  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.93 
 
 
879 aa  429  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.28 
 
 
949 aa  429  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.13 
 
 
960 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.54 
 
 
952 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  33.41 
 
 
918 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.31 
 
 
959 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 
979 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.6 
 
 
960 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.37 
 
 
950 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.91 
 
 
960 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.49 
 
 
977 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.08 
 
 
983 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 
950 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 
950 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.56 
 
 
983 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.99 
 
 
959 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.45 
 
 
925 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.1 
 
 
967 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 
969 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.51 
 
 
988 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.33 
 
 
953 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.97 
 
 
983 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.8 
 
 
951 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 
983 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.05 
 
 
906 aa  410  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.12 
 
 
944 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.44 
 
 
945 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 
983 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 
983 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.64 
 
 
966 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.14 
 
 
937 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.62 
 
 
913 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 
983 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.41 
 
 
989 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.91 
 
 
994 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.67 
 
 
989 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.09 
 
 
978 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.44 
 
 
989 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.56 
 
 
989 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.46 
 
 
979 aa  397  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.63 
 
 
956 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 
988 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 
988 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 
951 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  29.9 
 
 
957 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.92 
 
 
946 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.16 
 
 
957 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.46 
 
 
959 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.91 
 
 
927 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.94 
 
 
948 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.58 
 
 
946 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 
903 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.36 
 
 
956 aa  389  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.25 
 
 
973 aa  389  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.54 
 
 
948 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.92 
 
 
952 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.23 
 
 
948 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 
960 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>