More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0334 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  97.82 
 
 
229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  83.84 
 
 
229 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  81.22 
 
 
229 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  78.17 
 
 
229 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  78.6 
 
 
229 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  81.3 
 
 
230 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  79.04 
 
 
229 aa  368  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  62.03 
 
 
234 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  56.9 
 
 
234 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  53.02 
 
 
229 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  53.53 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  50.5 
 
 
234 aa  207  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  46.98 
 
 
233 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  45.89 
 
 
233 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  45.02 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  49.5 
 
 
226 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  49.5 
 
 
226 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  48.51 
 
 
226 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  45.77 
 
 
207 aa  185  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  51.98 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  46.19 
 
 
234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  45.05 
 
 
226 aa  181  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  44.78 
 
 
225 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  45.05 
 
 
226 aa  170  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  44.12 
 
 
225 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  42.35 
 
 
227 aa  164  9e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  43.65 
 
 
224 aa  160  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  44.67 
 
 
218 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  41.87 
 
 
228 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  49.14 
 
 
258 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  39.52 
 
 
227 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  37.25 
 
 
217 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  37.5 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  43.16 
 
 
217 aa  136  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  38.57 
 
 
241 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  36.73 
 
 
245 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  37.37 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  38.1 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  36.45 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  36.09 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  40.89 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  40.89 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  37.98 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  37.68 
 
 
230 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  38.14 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  38.14 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  39.41 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  37.85 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.21 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  37.44 
 
 
239 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
228 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  35.44 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.89 
 
 
228 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  34.5 
 
 
231 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  38.16 
 
 
228 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 
243 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 
231 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
236 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  38.46 
 
 
261 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  34.4 
 
 
271 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  35.24 
 
 
241 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  35.35 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.2 
 
 
241 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  38.16 
 
 
257 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  33.49 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  40.11 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  34.83 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  36 
 
 
248 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  39.32 
 
 
253 aa  115  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  32.72 
 
 
243 aa  115  5e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  37.14 
 
 
241 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  37.14 
 
 
241 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 
241 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  35.38 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.19 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  34.21 
 
 
239 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.56 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 
251 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  35.96 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  31.95 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  33.99 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  40.31 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  36.14 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  34.67 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  35.5 
 
 
250 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.64 
 
 
251 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  34.86 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  34.86 
 
 
251 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  35 
 
 
250 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 
243 aa  106  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>