More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0283 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  100 
 
 		 600 aa  1220    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  56.89 
 
 		 608 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 		 766 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 		 780 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 		 765 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 458 aa  364  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  39.38 
 
 		 764 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3467  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 540 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3180  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 540 aa  188  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.178138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3252  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 547 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0853  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0172043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0405  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 553 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 661 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 671 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 1519 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 494 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  40.5 
 
 		 661 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  39.59 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0915  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 800 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 1527 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 1527 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 1527 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.99 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.99 
 
 		 747 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0030  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 533 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 495 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.34 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  41.08 
 
 		 674 aa  158  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 837 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  37.07 
 
 		 621 aa  156  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 553 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 691 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 591 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 492 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  35.06 
 
 		 499 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 396 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 368 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  37.24 
 
 		 673 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.6 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 655 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 504 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 372 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.11 
 
 		 752 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 		 1168 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 567 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  36.48 
 
 		 465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 804 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 970 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  36.48 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 492 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  36.48 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  33.98 
 
 		 584 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 655 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 604 aa  147  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 566 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  36.77 
 
 		 234 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.96 
 
 		 516 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 394 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.63 
 
 		 598 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 592 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  34.29 
 
 		 458 aa  146  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  35.98 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  34.29 
 
 		 458 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  33.88 
 
 		 458 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 953 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  33.88 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  33.88 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  35.42 
 
 		 614 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 		 844 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  33.47 
 
 		 458 aa  144  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  34.02 
 
 		 672 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  33.88 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 842 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 584 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  34.29 
 
 		 458 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  36.55 
 
 		 367 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 395 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.75 
 
 		 578 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  37.25 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  29.05 
 
 		 611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0469  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 774 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  34.01 
 
 		 420 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5559  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.46 
 
 		 752 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 586 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.25 
 
 		 679 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  38.4 
 
 		 1379 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>